Bão Pongsona gây ra những cơn gió giật tới 278 km/h (173 mph/1 phút), khiến toàn bộ đảo Guam mất điện và phá hủy khoảng 1.300 ngôi nhà. Với tiêu chuẩn xây dựng tốt của những ngôi nhà và kinh nghiệm từ việc ứng phó nhiều cơn bão trước đó, không có trường hợp tử vong có liên quan trực tiếp đến bão Pongsona, mặc dù đã có một vài người đã thiệt mạng gián tiếp từ những mảnh thủy tinh vỡ. Thiệt hại trên đảo ước tính là hơn 700 triệu USD (vào năm 2002, tương đương 909 USD 2013), khiến cho bão Pongsona là một trong những cơn bão gây thiệt hại nặng nề nhất trên đảo. Cơn bão cũng gây thiệt hại nặng trên đảo Rota và các nơi khác trong Quần đảo Bắc Mariana.